Bakugan Interspace je sistem virtuelne stvarnosti, gde igrači mogu da se međusobno svađaju i učestvuju na turnirima. Prvobitno dizajniran da pomogne vežbanju i unapređenju veština Bakugana, brzo je postao mesto okupljanja mnogih entuzijasta. Tokom jednog od duela Danme Kuusou, Međuprostor se sruši, a on biva hladan. Pre nego što se osvesti, ponovo doživljava viziju Bakugana u međusobnom ratu. Eksplozija energije koja je pratila Danminu borbu i prouzrokovala isključivanje sistema šalje udarne talase širom galaksije, privlačeći pažnju Dvanaest reda, gundalijske organizacije. Oni se uvlače u Bakugan Međuprostor, tražeći jake prepirke da im se pridruže u njihovom predstojećem ratu sa drugom vanzemaljskom rasom, Neathians-ima. Danma i njegovi pratioci - Shun Kazami i Chouji Marukura - uskoro se nađu uhvaćeni u vanzemaljskom ratu. Međutim, koliko god se čini dalekim, sukob ugrožava sam suverenitet Zemlje i budućnost Bakuganske rase.