Nebeski zapisi govore o postojanju „Serafima“, rase božanskih bića koja daju blagoslov čovečanstvu i za uzvrat im nude molitve. Oni koji su pomazani sposobnošću interakcije sa ovim duhovima poznati su kao „Pastiri“. Nazvani herojima za svoje brzo pojavljivanje u kriznim vremenima, a plaše se i njihove moći, Pastiri su utisnuti u uobičajeni folklor zajedno sa Serafima.
Sorei je mladi čovek koji je ceo život proveo živeći u harmoniji pored Serafima u selu Elisia. Fasciniran mitovima Nebeskih zapisa, istražuje neke obližnje ruševine sa Mikleom - njegovim saputnikom iz detinjstva Serafima - nadajući se da će se osvetliti istorije Serafima sa čovečanstvom. Na nesreću, oni budu zarobljeni u dubinama istorijskog nalazišta tokom svoje istrage. Tražeći izlaz, nailaze na misterioznu devojku koja očajnički traži pomoć pastira da spasi svet koji je na ivici da ga proguta mrak. Uprkos Mikleovom upozorenju o uspostavljanju kontakta sa drugim ljudima, Sorei odlučuje da pomogne neznancu, što ga nesvesno dovodi bliže snu o mirnom suživotu čoveka i Seraphima.