Davno su svi ljudi živjeli ispod mora. Međutim, neki su ljudi više voljeli površinu i trajno napustili život pod vodom. Kao posljedica toga, oduzeta im je bogom dana zaštita nazvana "Ena" koja im je omogućavala disanje pod vodom. Vremenom se rascjep između stanovnika mora i površine proširio, iako je kontakt između ta dva naroda još uvijek postojao. Nagi no Asu kara prati priču o Hikari Sakishimi i Manaki Mukaido, zajedno s njihovim prijateljima iz djetinjstva Chisaki Hiradairom i Kanameom Isakijem, koji su prisiljeni napustiti more i pohađati školu na površini. Tamo grupa također upoznaje Tsumugua Kiharu, kolegu studenta i ribara koji voli more. Život Hikarija i njegovih prijatelja zasigurno će se promijeniti jer se moraju suočiti s duboko ukorijenjenom mržnjom i diskriminacijom ljudi na moru i s površine, olujama u njihovom osobnom životu, kao i nadolazećom olujom koja može dovesti do propasti za sve koji borave na površini.