U početku 21. veka, magija, za koju se dugo smatralo da je obična bajka, postala je sistematizovana tehnologija i uči se kao tehnička veština. U Prvoj Srednjoj školi, ustanovi za magove, učenici su podeljeni u dve grupe na osnovu ocena prijemnog ispita: „Pupoljci“, oni koji dobiju visoke ocene, raspoređeni su u Prvi kurs, dok su „Korov“ rezervni učenici raspoređeni u Drugi kurs.

Mahouka Koukou no Rettousei prati brata i sestru Tatsuju i Mijuki Šibu, koji su upisani u Prvu Srednju školu. Po polaganju ispita, čudesna Mijuki smeštena je u Prvi kurs, dok je Tatsuja ispao u Drugi kurs. Iako mu rezultati na praktičnim testovima i status „Korova“ pokazuju da je magično nesposoban, on poseduje izvanredno tehničko znanje, fizičke borbene sposobnosti i jedinstvene magijske tehnike - čineći Tatsuju neregularnim u magičnoj srednjoj školi.