Digimon Tamers odvija se u svijetu u kojem je popularna Digimon franšiza u bijesu, sastoji se od crtića, video igara i igre s kartama. Takato Matsuda je veliki obožavatelj Digimona koji je posebno opsjednut kartanjem i neprestano sanjari o svemiru u njemu. Jednog dana pronalazi misterioznu plavu kartu koju provlači kroz igračku skenera kako bi je koristio u popularnoj borbenoj igri. Njegova igračka odjednom zasvijetli i pretvori se u Digivice, a ispred njega se materijalizira Takatoov dizajn obožavatelj, Guilmon. Oduševljen izgledom za stvarni Digimon, Takato prigrli svog novog partnera i započinju njegove avanture kao krotitelja Digimona.
Takato brzo otkriva da biti krotitelj Digimona nije sve zabavno i igrice – u stvarnosti je mnogo opasnije od kartaških igara na koje je navikao. Divlji Digimon počeli su se pojavljivati širom Japana, izazivajući divljanje koje rezultiraju haosom i haosom. Naoružani svojim Digiviceom, koji može skenirati kartice za trgovanje kako bi ojačao Guilmona, Takato i njegov novi partner krenuli su u borbu protiv prevaranta Digimona. Zadatak im je zaštititi svijet od napada Digimon, dok misteriozna organizacija odlučna da eliminira sve Digimona i njihove Krotitelje vreba u sjeni …