Dok Izabrana deca i njihov partner Digimon žive srećno zajedno u ljudskom svetu, Taichi Yagami i Yamato Ishida, zajedno sa svojim prijateljima, posvećuju se održavanju ovog teško stečenog mira. Iako ujedinjena ovom urođenom odgovornošću, svako je već počeo da preduzima prve korake ka budućnosti, a ne da bude Izabrano dete.
Međutim, ovo novo putovanje prekida pojava Menoa Bellucci, američkog profesora specijalizovanog za Digimon istraživanja. Ona prenosi vesti o tome da je nekolicina Izabrane dece iz celog sveta pronađena u komi, a nigde nema njihovog partnera Digimona. Menoine istrage pokazuju da iza alarmantne pojave stoji nova vrsta Digimona: Eosmon, koji se krije u dubinama Interneta.
Da bi uspeo u ovoj misiji, tim mora da nastoji kroz sve veću udaljenost između njih i da se udruži poslednji put.