Kojomi Araragi, učenik treće godine srednje škole, uspeva da preživi napad vampira uz pomoć Meme Ošina, čudnog čoveka koji živi u napuštenoj zgradi. Iako je spasen od vampira i sada ponovo čovek, i dalje ostaje nekoliko posledica kao što su nadljudske sposobnosti isceljenja i poboljšan vid. Bez obzira na to, Araragi pokušava da živi životom normalnog učenika, uz pomoć svog prijatelja i predsednice Cubase Hanekave.

Kada prijateljica iz razreda Hitagi Senđogahara padne niz stepenice i Araragi je uhvati, on shvata da je devojka neprirodno bestežinska. Uprkos njenim protestima, Araragi insistira da joj pomogne, odlučujući da zatraži pomoć od Ošina, istog čoveka koji mu je nekada pomogao u sopstvenoj nevolji.

Kroz nekoliko priča koje uključuju demone i bogove, Bakemonogatari prati Araragija dok pokušava da pomogne onima koji pate od natprirodnih bolesti.